
L'histoire se déroule dans le Japon moderne et certains flashbacks nous ramène au Japon des années 1920.
Nae était une femme très belle qui vivait avant la Deuxième Guerre Mondiale. Elle était fiancée à Eijiro, qu'elle aimait, mais elle tomba amoureuse de Yuta. Le secret de sa famille était qu'ils possédaient une urne contenant des cendres de sirène, réputées pour ramener les gens à la vie, et guérir les blessures. Parce que Nae avait entendu parler de la chair de sirène, elle crut Yuta lorsqu'il disait qu'il était immortel. Nae voulait s'enfuir avec Yuta, et dis qu'elle le rencontrerait à la "Vallée Rouge" (un champ de fleurs où elle avait dispersé les cendres de sirène) où les fleurs ne fânaient jamais, ne mourraient jamais, et ce dans toutes les saisons.
Yuta éprouvait des sentiments pour Nae, mais il ne pouvait rester avec elle parce qu'il était immortel, et également parce qu'elle était fiancée à Eijiro. Sur ce, bien qu'il ait promis de la rencontrer dans la Vallée Rouge, Yuta décida de quitter la ville sans tenir sa promesse. Yuta n'avait pas imaginé que quelqu'un d'AUTRE puisse l'attendre (Nae) dans la Vallée Rouge...
Yuta n'était pas allé à la Vallée Rouge pour rencontrer Nae car il savait qu'elle serait plus heureuse sans lui .... ou plutôt, c'est ce qu'il pensait. Il ne pensait pas qu' Eijiro se sentirait coupable au point d'aller rencontrer Nae, mais que, pris d'un accès de folie il la tuera. Plus tard, il la ressuscitera et il s'avéra que les cendres de sirène avaient préservé bien plus que les fleurs... Et Nae n'oublia JAMAIS la promesse qu'elle avait faite avec Yuta...de le rencontrer dans la Vallée Rouge, même après sa mort.
Mana commence à devenir plus "adulte" au fur et à mesure que l'histoire avance, alors qu'elle ignorait tout du monde extérieur lors des premières histoires ! Mana a découvert qu'elle éprouvait des sentiments pour Yuta... bien qu'elle ne sache pas exactement ce que cela signifie. Plusieurs fois, on lui a demandé si elle était la petite amie de Yuta, d'abord Towa dans Ningyo no Mori, auquel elle répond qu'elle est juste une "amie" et qu'ils voyagent ensemble. Mana, toutefois, réalise qu'elle a peur de quitter Yuta un jour. Lorsque Yuta découvre que Nae est toujours en vie, elle devient jalouse. Yuta se rend compte que Mana a effectivement grandi et qu'elle est tombée amoureuse de lui. Mais la relation qui les unit passe toujours en second plan par rapport à l'histoire elle-même, qui reste résolument noire.